Возможно ли прилететь в Казахстан только с российским паспортом, без загранника? Не будет ли проблем с перелетом или оформлением уведомления?

Между странами ЕАЭС допустимо перемещаться только с использованием внутренних документов. В частности, вы можете въехать в РК из РФ по общегражданскому паспорту Учтите ограничения, что вы не сможете открыть банковскую карту без загран. паспорта, не сможете запросить разрешение на проживание больше 90 дней. Очередь на загран. паспорт в консульстве РФ на территории Казахстана не меньше 3 месяцев, паспорт оформляется дополнительно 3 месяца.

Точно не будут будут только неудобства из за отсутствия загранпаспорта.

Да, конечно, то что будут другие неудобства, это уже отдельный разговор.