Правильно ли, что после подачи на учебную визу с recibo de presentación en oficina de registro я обратно не залечу в Испанию, не имея Шенгена(истечет)?

Правильно. Без действующего Шенгена не залетите. Recibo de presentación лишь урегулирует Ваш легальный статус до моменты выхода решения миграционной службы на территории Испании и только Испании.