Нужно ли делать регистрацию с квартиры, если уже сделал уведомление о прибытии в гостинице (для нахождения 90 дней)?

Если сменили адрес проживания, то да надо уведомить и внести в базу данных миграционной службы.

Нужно Потому что участковый может придти по адресу и проверить. При такой нагрузке не успеют конечно везде пройтись, но вероятность есть. Просите Хозяйку уведомить.

Уведомление это обязанность хозяев жилья, а не иностранца

При каждом переезде в новый город вы должны делать новое уведомление. это касается и тех кто гражданин Казахстана.