Может кто подскажет, брат жил в Эстонии по временному ВНЖ, есть жильё в собственности, действующая фирма.

Напишите в миграционный отдел PPA и/или на почту PPA. Они должны отвечать в +/- 5 рабочих дней, долго, но хоть ответ точно корректный будет. Можно ещё к консулу в стране гражданства вашего брата обратиться, или в стране где планируете подаваться если в стране гражданства нет консула. В такой же ситуации Литва отказала моему знакомому недавно.