если добраться до Еревана из моего города на самолёте возможно только с пересадкой, то как оформлять билеты? Можно ли оба на российский паспорт, или загран обязателен?

Из России в Армению можно по внутреннему паспорту. Если пересадка в другой стране то загранпаспорт нужен.

Можно. Я по внутреннему паспорту РФ, прилетел из Казахстана в Армению.