Вопрос, в Кыргызстане рублями можно расплачиваться везде (кафе, за жилье)? Или есть проблемы с рублями.

Не сможете. Только сомы. В редких случаях доллары США по невыгодному курсу.

Рублями максимум расплатитесь за такси из аэропорта.

Нет, у них своя валюта. Но при необходимости, если сомов нет, можно договориться. Курс примерно 1,32.