Через Эстонию транзитом из РФ в Германию пропустят с визой D немецкой?

Да, должны. Но решение остаётся за сотрудником эстонской пограничной полиции.

Въезд по визе D немецкой в Эстонию разрешён. Наличие визы D не даёт автоматического права на въезд. Сотрудник погран. службы имеет право запросить дополнительные документы, подтверждающие цель и условия пребывания на территории шенгенской зоны. Всё, что нужно знать на 03.11.2022.