посоветуйте пожалуйста как лучше посетить пещеры Прометея: взять экскурсию или остановиться в Кутаиси на одну ночь и отправиться туда самим? Буду признательна за ответ.

Да просто взять машину в аренду и одним днём скататься.

Лучше самим, там экскурсия условная. Собирают толау и ведут по пещере, экскурсовод говорит по паре предложений в каждом месте остановки.