Подскажите, если лететь на самолёте из Таллина в Стокгольм имея при этом гражданство Швеции, нужен ли ПЦР тест?

Если в Швеции сняты ограничения, то нет. Тем более это внутри ЕС.

Я летела из Италии в Стокгольм, из Стокгольма в Таллин, нигде ничего не спрашивали, маски тоже нигде не просят одевать.