Подскажите, пожалуйста, если свидетельство о браке получено в регионе, не в Москве, то апостиль на него можно будет в МСК поставить?

Нет, нельзя. Но можно в Москве получить дубликат и поставить апостиль на него. Более того, если Вам для реюниона, то дата выдачи свидетельства на момент подачи не должна быть старше 6 месяцев, а, следовательно, Вам наверняка потребуется получать дубликат, возможно даже не сейчас, а позднее, и его апостилировать.