Пожалуйста, подскажите, пребывая по шенгену до 90 дней в Сербии, тратятся ли дни самого шенгена?

Забудьте про 90, сидите по 30.

Не надо по шенгену пребывать в Сербии. 30 дней и визаран. Повторять до дзена.

Шенген не имеет отношения к Сербии вообще.