Подскажите пожалуйста. У меня российское гражданство, но загранпаспорт ещё не оформлен.

Если вы отказались от украинского гражданства, то ваш паспорт должны аннулировать. Если не отказывались официально, то паспорт действует. Пропусят ли эстонские пограничники? Если украинский паспорт биометрический и действующий, то виза вам не нужна и срок пребывания в ес 90 дней.