собираюсь покинуть территорию Мариуполя через Россию, имею Украинский I'd паспорт и просроченный загран Удастся ли мне пересечь границу эстонии что бы дальше поехать в Литву?

Если вы будете въезжать как беженцы, то неважно какой паспорт. По крайней мере так было до последнего момента.

Просто покажете внутренние паспорта и возьмёте бумажку о том, что вы пересекли эту таможню в это время и дату, что вы там въехали в ЕС, чтобы в дальнейшем полиция не искала где и как вы попали в Европу.