А если срок действия паспорта подойдёт к концу, имея ВНЖ можно его будет перевыпустить находясь в Турции? Или паспорт делать только в РФ?

Можно, но насколько это у вас получится - трудно сказать. Надо вылавливать запись в консульство России. Неизвестно на какую дату выловите. После обращения ждать 3 месяца (утверждается) а там может больше, может меньше.