Есть ли смысл лететь из Стамбула в Сербию через Франфрукт? Есть же много прямых рейсов.

Потому что многие на агрегаторах привычно покупают типа "единый" билет из точки в точку, плюс цена. А по факту это набор разных билетов разных а/к с нюансами типа выхода из чистой зоны для пересдачи багажа и отсутствия автоматической пересадки на следующий рейс при задержке предыдущего.