подскажите пожалуйста, могут ли возникнуть проблемы с регистрацией если в паспорте рф фамилия супруга а в загранпаспорт девичья ?

Вылет/прилет осуществляется по загранпаспорту в большинство стран, внутренний паспорт у вас не попросят. Другое дело если вы оформили билет на фамилию Иванова и предъявляете загранпаспорт с фамилией Петрова.