Если заехал в Албанию до 30.09 и есть открытый шенген, то можно спокойно выезжать в октябре? Или 30.09 куда то выехать и въехать обратно надо?

Нужно при въезде на границе показать свою шенгенскую визу и настоятельно попросить отметить въезд именно по ней. Находясь в Албании в ближайший день после пересечения посетить Миграционку и попросить проверить правильность въезда по визе. В случае если на границе не будет отмечен въезд по шенгену все дальнейшее, после безвизового периода, пребывание будет считаться нарушением.