Подскажите пожалуйста, стоит ли писать в консульство Испании, на электронный адрес, если паспорт делается уже долго, а у нас скоро вылет? Не навредим ли мы сами себе?

С учётом отмены упрощённого порядка, сейчас вплоть до 45 дней могут делать. Вопрос только относится это к подавшим с 12.09 или и к более ранним, но не выданным? По логике, вы же билеты прикладывали, значит это учтут при выдаче визы.