Есть ли смысл, чтобы избежать овербукинга на рейсах Сербских авиалиний, приезжать сильно заранее, за 5-6 часов, если регистрация начинается в аэропорту только за 3часа до вылета, а онлайн чек ин не делают с Москвы и СПБ?

Овербукинг это когда компания или ее партнеры продают больше билетов, чем мест. То, что вы придёте раньше никак на это не повлияет. Ну, опаздывать тоже не нужно. Но если у вас есть уже билет и место, то бояться вам овербукинга не нужно.