Высшее образование я получил по сокращенной программе ( 3 года) на основе диплома колледжа ( 5 лет, повышенный уровень).

У меня была аналогичная ситуация, 3 года колледж и 3 с чем то вуз. Отправлял оба диплома.

У меня было второе высшее по сокращенной программе (3 года) - признали мастером, как обычно, т. к. в описании есть "нормативный срок обучения - 5 лет". Но если пошлете 2 диплома, ничего страшного не будет, а вам спокойней.