Подскажите, пожалуйста, может ли мой основной NOC, по которому я подаюсь в EE, быть отличным от того NOC, по которому я работаю в настоящее время?

Названия могут быть разными, но обязанности должны совпадать.

Без разницы, какой NOC вы укажете в качестве праймари. Это ни на что не влияет. Теоретически, если какая-то провинция захочет вас выбрать, она может обратить внимание на праймари NOC, но пока достаточных данных, чтобы это утверждать, у нас нет. Вернее, есть пример Альберты, которая пригласила человека по NOC-у, по которому у него было большой опыт, но этот NOC не был указан праймари, по другим провинциям я таких прецедентов не видела.