Такой вопрос, может кто подскажет, уже имею гражданство РФ, и имею уже вид на жительство в Кз.

Да, вы правильно описали алгоритм действий. 1) уведомить о ВНЖ в кз. 2) прописаться 3) встать на ВУ.

Приезжаете в РФ, уведомляете, что есть ВНЖ в КЗ, делаете регистрацию (можно постоянную, можно и временную, но по временной поставят на учет только на срок действия регистрации, и сама регистрация не должна быть менее 6 месяцев), идете в военкомат, проходите медкомиссию, получаете военник. Никакого штрафа не будет, потому что на воинский учет нужно встать в течение 14 дней после регистрации. Т. к. у Вас не было никакой регистрации в РФ и Вы не жили в РФ, то встать на учет не могли. Если возраст не призывной, то максимальный штраф 500 рублей. Если призывной, то тут могут и до уголовки завести. НО! Нужно давить на то, что Вы не жили в РФ все это время. Показывать загран со штампами пересечения границы, запрашивать справку с границы (хотя в РФ это нереально запросить), показывать ВНЖ итд, т. е. убеждать всеми силами.