Можно ли в ЕЕ иметь один нок, а в порталах провинциальных программ (к примеру, NB), указать другой нок, тоже абсолютно подходящий, смежный? Или же они должны быть везде одинаковы?

А с какой целью вы хотите так сделать? В принципе указать вы можете все, что угодно, хоть совсем разные NOC, главное, чтобы потом это все друг с другом билось, если вас пригласят подавать документы. То есть, например, вы создали профиль ЕЕ и решили указать NOC XXX. Дальше вы нашли работу по похожему NOC YYY, подались по провинциальной программе с поддержкой работодателя, и прошли по этой программе, получив в конце концов PR. В вашем ЕЕ так и остался другой NOC, но это не имеет значения, т. к. по ЕЕ вам ITA не приходило, опыт работы по указанному NOС вы не подтверждали, и вообще к тому времени как вы получили ПР по провинциалке, ваш профиль ЕЕ истек. Никакой проблемы такая ситуция вам не доставит. А может быть, вы создали профиль ЕЕ, указали NOC XXX, потом прошли по провинциальной программе с похожим NOC-ом YYY, получили номинацию в профиль ЕЕ, получили ITA. В этом случае, вам нужно будет сменить в ЕЕ NOC XXX на NOC YYY, т. к. этим же самым референсом, в котором вы подтверждали опыт по NOC YYY на провинциальном этапе, подтверждать опыт работы по NOC XXX не стоит, да и смысла в этом нет никакого. Может быть, конечно, у вас какая-то другая ситуация планируется, но тогда нужно больше подробностей, чтобы дать точный ответ.