Кто летал wizz air или подобными авиакомпаниями? Если билет с багажом стоит дороже, чем если купить билет без багажа, можно ли купить отдельно место багажа? Или потом могут возникнуть вопросы на чекине?

Не возникнет. В основном так и покупают. Но дешевое так брать багаж в 10 кг. Более того - есть вариант с покупной "приоритетной посадки", где добавляется ещё одна "ручная кладь" в 10 кг (то есть можно с собой в салон взять рюкзак + чемодан!), но тут ограничения размеров имеются.