Не аннулируют ли финскую визу после Эстонии при въезде в Финляндию? Это где-то отмечается?

Думаю у них в базе видно.

Главное, что бы к концу визы посещений Финляндии по дням было больше.

Нет. Не бойтесь.

Нет, у меня такая же ситуация и ещё потрачено почти все 90 дней в полугодии, тоже боялась, но ничего не сказали, молча поставили штамп. Но теперь буду откатывать только финку по возможности.