А вообще возможно ли не пускать кого-то в страну внутри шенгена? Если ещё с наличием внж другого государства-участника шенгенского соглашения?

Ну вот видимо с этим и связано то, что не пускать собираются только обладателей эстонского шенгена Видимо страна сама имеет право решать, как поступать с визами, которые она выдала САМА.

Как показал ковид, может. но в данном контексте речь об этом не идет. если у россиянина внж или виза с любого другого государства ЕС, то его пропустят через границу. а вот если у него виза с выданная Эстонией и он не попадает под исключения, то его не пустят.

Я так понял, что Эстония аннулирует выданные шенгенские визы для туристических целей вот и все.