если из Черногории лететь в Санкт-Петербург через Стамбул, нужен ли ПЦР (сертификат есть). гражданство беларусское?

Нет.

Нужен, вы не гражданин РФ. Хотя, там что-то писали про нововведения, что вроде как "без границ" но проще сделать, чтобы не доказывать.

Да, нужен пцр, т. к. считаетесь иностранцем.