можно ли оплачивать аренду квартиры в австрии со счёта в Грузии? Или надо обязательно с австрийского?

Формально не проблема. но вероятно нужно договориться с лендлордом, потому что деньги на приём у него застрянут. Если вы ему пообещаете, что в случае зависшего перевода, вы переведёте с другого счёта, то вероятно он согласится.