На выезде из РФ требуют второй паспорт показать когда не видят шенгена?

Да, если у Вас два гражданства (и два паспорта, соответственно), то попросят показать оба.

Пограничники не контролируют визы иностранных государств. Для выезда нужен действительный заграничный паспорт, согласно Закону " О въезде в РФ и выезде из РФ". Но попросить показать, конечно, могут.