Приезжаю в португалию и подаюсь на резидентство. Но мой обычный шенген в паспорте закончится. Как мне ездить из Португалии в Россию и обратно?

До получения пластика не выезжайте, иначе рискуете не въехать обратно. Потом - каждый раз у вас с собой должен быть загран + карточка, это типа как ваша виза. и в россии, кстати, вы должны уведомить органы о получении внж. вроде так.