внутри Шенгена нет ограничений на въезд в Италию? Например из Будапешта? Если я покупаю билеты Будапешт-Милан-Аликанте, в Будапеште показываю венгерскую визу, потом лечу в Испанию через Италию, такой вариант работает?

Точно знаю, что у итальянцев до 31.01 5дневный карантин для прибывающих из Испании. Работает ли это в отношении пассажиров из других стран, нужно проверять у итальянцев на официальном сайте. Лучше проверьте, чтобы не попасть.