Рассматриваем вариант выезжать из РФ в Эстонию на своей машине. Это возможно? Или только пешком/автобус?

Если вы в Эстонию, нужна вакцина. Обязательно. Любая. Если вы транзитом, то смотрите требование страны назначения.

Исключительно про жилье в собственности! На сайте департамента полиции заполнить анкета-заявление (найдете), приложить документы на собственность. Полиция присылает ответ. Если положительный, это является основанием для въезда. Нужно распечатать (обязательно) и все это незадолго до въезда. Пару недель пройдет - недействителен. Опыт родственников.