если у меня бронь на 1 ночь в спа отеле, а потом я лечу в другую страну, то так и говорить - «1 ночь лечения в отеле, потом лечу на 3 недели туда и туда? » Как они это воспринимают?

Ни в коем случае не говорить "лечение"! Лечение - для российской границы, для эстонской - Вы едете как турист.

Говорите как есть. Но и те другие пограничники в курсе этого «лечения», поэтому первым для галочки говорите «основание доя выезда — лечение», а вторым, что едите в спа.

А вы там лечиться будете в отеле? Всю ночь? Говорить: на одну ночь останавливаюсь в отеле. Потом самолет в Милан. Про лечение - это только для наших пограничников.