При заполнении флайпасов я перепутала своё и мужа номера мест в самолёте, они соседние. Могут на это обратить внимание в аэропорту Ларнака?

Ну сами посудите, откуда в аэропорту будут знать на каком месте вы летели. Место вообще можно не указывать. Тк регистрация во флайтпасс за 48 часов, а место люди узнают за 24 при он-лайн регистрации, либо вообще уже в аэропорту.