Может кто-то сталкивался или знает - некоторые работодатели в Праге предлагают в качестве бонуса дополнительные отчисления пенсионное страхование - если вдруг соберешься уезжать из чехии, эти деньги можно как-то забрать?

Нет нельзя.

Это дополнительная пенсия, можно её забрать. За вычетом государственной помощи и налогов.

Посмотрите договор с фин. учреждением. Некоторые позволяют забрать часть суммы по достижении определенного возраста, некоторые - определенную сумму. Все зависит от того, что и как прописано в договоре.