Подскажите с сертификатом из госуслуг о том что переболел пропустят в Эстонию для транзита?

Для транзита в страну где у вас внж/гражданство - да, во всех остальных случаях - нет.

Я не уверен что единый российский сертификат, в котором есть только запись что переболел, но нет записей о прививках и актуальных пцр-тестах "прокатит". Во первых стандарты раскрытия данных о том что "переболел" в российском сертификате и европейском отличаются. В российском меньше инфо, будь они близки по сожержанию к евросерту переболевшего / может и у туристов бы их принимали. Во-вторых, есть инфо что пускают быстротранзитников к месту проживания именно по ПЦР. Ну и в третьих, а ведь это зависит от того в какую страну человек показал билеты, вообще на каком ковидзащитном основании его туда пустят? Если пускают только по европрививке то и не судьба значит, не может эстонский пограничник ено пропустить - европрививки чтобы улететь нет, а Спутника нет чтобы в Эстонии остаться. Ну а если ПЦР нужен в страну прилета (знаю, кстати, авиакомпании, которые в принципе не пустят на борт без ПЦР) - то погранец должен убедитьмюся что есть ПЦР и он отрицательный.