Есть вопрос по поводу налогов, может быть кто-то в курсе. Облагается ли налогом доход полученый на счет и через ИП в третьей стране?

Да, все доходы подлежат декларированию вне зависимости по какому основанию приехали, некотомы кажется, что если они приехали по Д7, то у них осовый статус, на практике, все налоговые резиденты в правах и обязанностях равны. Тем более если эти средства поступили через португальское ИП.