Подскажите, если Дядя живет в Эстонии, это может являться причиной для удовлетворения приема на визу? + ещё в том, что у него такая же фамилия как у меня.

Лучше уточнить в консульстве.

Сегодня звонила по такому же вопросу в погранохрану - для посещения родственников (гостевая виза) подходят только родители, прародители, дети и внуки. Сестры, братья, дяди, тети близкими родственниками не считаются.

Ei. Нет. Только близкие родственики.