Подскажите пожалуйста, можно ли податься на шенген в другом городе (Москва), если прописка в СПб. Но справка с работы подтверждает мою состоятельность, да и в принципе она тоже Московская.?

Конечно можно. только если была 2 летняя виза до этого.

Податься можно, но это странный поступок - финские мультивизы лучше и на хорошие срок выдают именно жителям Северо-западного региона, как граничащего с Финляндией. Не использовать это преимущество как минимум странно.