Может кто нибудь объяснить конечный процент налога который по итогам первого года нужно будет выплатить если по ИП легализоваться в Португалии?

Я так понимаю прогрессивная шкала для резидентов. Нерезиденты платят 25% на всё, что в итоге выходит примерно на 10% больше. Но первый год не платится социальный налог, слава богу. Потом вы станете резидентом и подоходный уменьшится, зато добавится социальный приблизительно в том же объёме. Налог считается на дату получения дохода, так что первые полгода точно придётся считать как нерезидент.