Подскажите, пожалуйста, если загран заканчивается в ноябре месяце, не будет ли никаких проблем с въездом и нахождением на территории Португалии? И можно ли там на месте сделать новый в посольстве?

Я не в теме Португалии, но прямо сейчас делаю себе второй загранник. Знакомые из-за границы рекомендовали сделать его на территории РФ, если сейчас есть такая возможность, так как это быстрее и легче.

По плану, в любом консульстве РФ можно сделать новый загран паспорт. Вероятно чуть дольше, чем в РФ. Имеет смысл проверить, как сейчас работает консульство РФ в Португалии.