Подскажите, пожалуйста, подала на визу Японии, но перепроверила анкету и поняла, что ошиблась с написанием места рождения. Не дописала область.

Поводом к отказу это не станет. Оч странно, что в ВЦ не увидел таких явных моментов. Но все должно быть ок (если речь именно про эти моменты), отслеживайте готовность на сайте.