Подскажите пожалуйста, подаюсь на визу США в Варшаве. У меня два российских загран паспорта. Могу ли въехать в зону Шенгена по одному паспорту, где есть Шенген, а на визу США отдать другой паспорт где Шенгенской визы нет? Не будет ли вопросов?

Да, можете

Можете. Но подать вы должны паспорт на вклейку визу тот, который указан в анкете. Или попросить на месте уже вклеить в другой паспорт, но это на усмотрение офицера только.

Вопросов точно не будет, это две параллельные прямые)

Именно так и имеет смысл поступить