Подскажите,пожалуйста, какой сейчас самый короткий и дешевый по стоимости путь до Литвы через другие страны из России, СПб ? Какой страны визу лучше открыть?

Все зависит от стоимости билетов. Вам придется самостоятельно мониторить. В любом случае для визы пригодится. Ведь подешевле надо и выехать из РФ, потом недорого въехать в Шенген и третий билет Литва (Каунас или Вильнюс). Довольно большая работа, цены плавающие. За пределами РФ цены на авиабилеты умеренные (в пределах эквивалента 5 тыс руб). А вот вылет из РФ в среднем от 10 до 30 тыс. Надо быть готовыми к таким расходам. Плюс возможные ночевки. Все же состыковать три рейса сложновато