А можно ли отменить запись по визе Германии на одного из двух поданных в заявке? Т.е. подавали на 2 человек, из них один не успевает

Если это была одна заявка на двоих (т.е. один имэйл и одно подтверждение), то нет. В противном случае отменить-то можно, но деньги вам не вернут (точно не без скандала и досудебок)

Смысла в этой отмене нет, если один из заявителей все же будет подавать на визу, т.к сервисный сбор не возвращается.