Пробовал пересечь границу Эстонии, но меня не пустили, поставили в молдавский паспорт штамп и написали букву E чем это черевато для дольнейших поездок?

У Вас отсутствовали документы, подтверждающие цель и условия Вашей поездки.

Вам нужно показать прописку в Молдове, билеты на весь маршрут, нал деньги по норме, нероссийскую страховку.

Помимо этого Вам придется пояснить историю и цели прошлых въездов в шенген, а также цель поездки ( пребывания) в рф и род занятий. Придется также пояснить обстоятельства получения Вами пасп рф.

При выполнении этих условий Вас допустят в ЭР.