Если проживание в апартах в Черногории планируется только в 1 и последнюю перед вылетом ночь, остальные дни в палатке - то как быть с регистрацией? Достаточно ли той, что будет в первую и последнюю ночь?

Не достаточно. Первая ночь будет регистрировать объект. Потом Вы сами в той общине куда пойдёте. И если в эти дни не будет регистрации то последний объект уже не сможет зарегистрировать(будет более чем 24 часовой разрыв).

Как вариант попробовать попросить первый объект зарегистрировать Вас на все дни до последнего. Скорее всего откажется. Дальше хуже. Туристы неизвестно куда идущие и неизвестно где ночующие это загадка для системы. В кемпингах регистрируют администраторы. А вот живущих под деревом.....Можно попробовать зарегистрироваться перед выходом. Поговорить в турорге первого дня.