Недавно получили визы Японии и теперь у меня встал другой вопрос, видел ранее информацию про миграционные карты, подскажите пожалуйста, что это такое и какие еще подвохи будут в процессе перелета?

Никаких подвохов, если не собираетесь выходить в Китае (если пересадка там) и оформите QR для прилета

Если для Японии.. на визит джапан веб заходите, всё сейчас заполняете. Получаете кр код , скрините. И спокойно проходите все инстанции по прилёту