Планирую путешествие с животным. Подскажите, пожалуйста, если должны были лететь с собакой по маршруту Москва-Стамбул-Мадрид транзитом ( пегасус)

, но выйдем из транзитной зоны, будут ли потом проблемы на регистрации с теми доками на собаку, которые получили в Москве? Когда получали документы в аэропорту, говорили, что из транзитной зоны выходить не будем, но не успеваем на стыковочный рейс и возможно выйти все-таки придется?