Правильно понимаю, что в Японии проездной jr kyushu pass можно купить на Косю и там не нужен ваучер как с обычным пасом? Есть ли возможность купить в Кагосиме?

Ну если есть иностранная карта, то можно купить на их сайте. Если нет, то на Трипком.

На станции Кагосима-Чуо можно обменять, но не на станции Кагосима.

Купить на станции нельзя, только онлайн. Ваучер - обычная бумажка, которая вам на почту приходит. Можно не печатать если у вас все паспорта биометрические - тогда сами получите пасс в автомате.